LabChip® GX Touch 微流體技術(shù)簡(jiǎn)化了平板電泳的諸多人工步驟,并提供對(duì)基因組研究,無(wú)論是 PCR 前還是 PCR 后的工作流程都至關(guān)重要的樣品完整性及其他各項(xiàng)全面質(zhì)控。采用便捷的觸摸屏界面,即使是臨時(shí)用戶都可很快上手,方便準(zhǔn)備和運(yùn)行樣品。
The LabChip GX Touch 提供:
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觸屏點(diǎn)擊式快速樣品分析 – 僅需 30 秒/樣品;
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量化評(píng)價(jià) RNA 和 DNA 樣品完整性,確保只有最佳的樣品用于下游分析檢測(cè);
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最高批處理通量 24 個(gè)樣品的高效平臺(tái)節(jié)約時(shí)間和試劑用量;
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最高批處理通量 384 個(gè)樣品的型號(hào)則適用于高通量工作流程
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數(shù)據(jù)輸出選項(xiàng):電泳峰圖、虛擬膠圖或數(shù)據(jù)表格形式。
無(wú)論您的測(cè)序?qū)嶒?yàn)室需要分析稀缺和珍貴樣品,還是運(yùn)行PCR-free的流程,亦或是需要對(duì)樣品中的每個(gè)片段定量以進(jìn)行基因分型分析,方便易用、成本低、通量高且靈活的 LabChipGX Touch 系列可以極大地減輕分析日益增多的樣品的負(fù)擔(dān)。
Touch — 人性化操作
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加載樣品板和芯片
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選擇樣品(一次最多運(yùn)行 384 個(gè)樣品)
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選擇實(shí)驗(yàn)類型
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觸點(diǎn)“運(yùn)行”,開始實(shí)驗(yàn)
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您甚至可以讓系統(tǒng)自動(dòng)將數(shù)據(jù)直接導(dǎo)出到您的網(wǎng)絡(luò)或LIMS 系統(tǒng)
運(yùn)行 — 實(shí)時(shí)觀察運(yùn)行
回顧 — 實(shí)時(shí)查看數(shù)據(jù)或?qū)С鲆源蘸蠓治?/strong>
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選擇以電泳峰圖、虛擬膠圖或數(shù)據(jù)表格形式顯示
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使用 TIPCO SpotFire® 數(shù)據(jù)可視化軟件強(qiáng)化分析結(jié)果
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收集選擇多板樣品的數(shù)據(jù)進(jìn)行平行分析比對(duì)
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挑選過濾具備關(guān)鍵屬性應(yīng)用的數(shù)據(jù)
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突出顯示目標(biāo)峰譜
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兼容 LabChip GX 和 LabChip GX Touch 數(shù)據(jù)
LabChip GX Touch 軟件能夠通過最少量的人工選擇運(yùn)行實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)設(shè)置參數(shù)文件可下載到儀器上,并通過觸摸按鍵執(zhí)行。自動(dòng)保留最近一次實(shí)驗(yàn)運(yùn)行的參數(shù),以方便以相同的實(shí)驗(yàn)參數(shù)繼續(xù)運(yùn)行多批樣品。
數(shù)據(jù)查看軟件模塊可幫助科學(xué)家從遠(yuǎn)離實(shí)驗(yàn)室的工作區(qū)查看已完成的樣品。軟件的使用許可證無(wú)數(shù)量限制,同事之間可共享數(shù)據(jù),使得項(xiàng)目合作變得簡(jiǎn)單而直接。數(shù)據(jù)查看軟件支持由LabChip GX Touch 和 LabChip GX 平臺(tái)生成的文件類型。LabChip GX Touch 數(shù)據(jù)文件是 TIBCO SpotFire® 兼容的(可選功能)。
電泳分析是二代測(cè)序文庫(kù)質(zhì)控的重要環(huán)節(jié),它可同時(shí)提供每個(gè)樣品的片段大小以及定量信息。LabChip GX Touch 自動(dòng)完成 DNA 和 RNA 片段以及 smear 樣品的片段大小和濃度分析,用于測(cè)序的文庫(kù)樣品的質(zhì)控。片段樣品分析通常用于交叉檢驗(yàn)片段化或者 PCR 步驟的效果。文庫(kù)樣品的DNA 總量分析均一化步驟。
節(jié)約樣品
減少分析時(shí)樣品的消耗,是很多實(shí)驗(yàn)室考慮的重要因素。對(duì)于諸如染色體免疫共沉淀測(cè)序和 PCR-free 等方法制備的濃度非常低的文庫(kù)樣品,這一點(diǎn)至關(guān)重要。NGS 3K 試劑盒就是專為這類有特別高靈敏度要求的測(cè)序流程而開發(fā)的。LabChip 可以對(duì)濃度低至 2.5pg/μL 的 smear 以及 0.5pg/μL 的片段進(jìn)行準(zhǔn)確定量,實(shí)現(xiàn)對(duì)稀缺和珍貴樣品的快速分析(圖4)。
快速分析 RNA
LabChip Touch 平臺(tái)提供了易于理解的 RNA 濃度以及核糖體 RNA的比例,與 RNA 質(zhì)量評(píng)分共同用作完整性評(píng)價(jià)指標(biāo)(圖 5)。RNA 質(zhì)量評(píng)分 (RQS) 是對(duì)樣品的質(zhì)量和完整性的量化評(píng)價(jià),可預(yù)測(cè)下游基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)(如芯片分析或?qū)崟r(shí) PCR 等)的成功幾率。
除 RQS 值外,分析軟件現(xiàn)在可以自動(dòng)計(jì)算 DV200 值。這兩個(gè)值可以導(dǎo)出,并用于確定來(lái)自諸如 FPE 標(biāo)本的 RNA 樣品的質(zhì)量。經(jīng)驗(yàn)證,RQS 與 Agilent® RIN(RNA 完整性指數(shù))密切相關(guān)并遵循相同的 0-10 量化評(píng)級(jí)。
基因組 DNA 樣品降解評(píng)分
為 LabChip GX Touch 系統(tǒng)開發(fā)的基因組 DNA 實(shí)驗(yàn)創(chuàng)新性的引入了基因組 DNA 質(zhì)量評(píng)分(GQS),替代傳統(tǒng)的凝膠電泳。所提供的電子數(shù)據(jù),兼容實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)、可以輕松歸檔和分發(fā)。可在 30 - 60 秒內(nèi)快速分析 25 - 12000bp 的 DNA 樣品(對(duì)于gDNA 完整性檢測(cè)上限可達(dá) 40000 bp)
工作原理
LabChip 電泳在小型微流體芯片上進(jìn)行。將芯片裝載入LabChip GX Touch 系統(tǒng)后,芯片孔與鉑電極接觸,由鉑電極提供電壓和電流控制。系統(tǒng)機(jī)械臂將微孔板上的樣品孔直接移動(dòng)到芯片的毛細(xì)管“吸管”下方,約 150 nL 樣品被抽吸到芯片上。待分析樣品逐一被電泳分離,樣品條帶被激光誘導(dǎo)熒光檢測(cè)。通過 ladder 及內(nèi)標(biāo)確定各條帶的大小和濃度。